A medida que la atención médica se digitaliza cada vez más, los científicos, médicos e investigadores deben tratar de descifrar cantidades de datos sin precedentes para personalizar adecuadamente la atención. El exceso de información disponible para estos expertos a menudo excede su capacidad para consumirla y analizarla. AmazonasEl módulo de la nube cierra esta brecha.
Amazon Web Services lanzó recientemente la disponibilidad general de Amazon Omics, que ayuda a los investigadores a almacenar y analizar datos ómicos como proteínas y secuencias de ADN y ARN. El servicio proporciona a los clientes la infraestructura básica que necesitan para dar sentido a grandes cantidades de datos para que puedan pasar más tiempo descubriendo nuevos descubrimientos científicos.
AWS genera una gran parte de los ingresos de Amazon, generando 20.500 millones de dólares en el tercer trimestre. El negocio de la computación en la nube se ha expandido a la atención médica y, si bien AWS no divulga pronósticos de ingresos para servicios específicos, se espera que el mercado global de análisis de datos genómicos alcance los $ 2150 millones para 2030, según un informe de Straits Research.
La gran mayoría de los datos de atención médica no están estructurados por naturaleza, lo que significa que aproximadamente el 97 % no se utiliza, dijo el Dr. Taha Kass Hout, director médico de AWS. Catalogar y comprender esta información es un desafío, especialmente cuando los investigadores recopilan datos ómicos de decenas de miles de pacientes.
Antes de Amazon, Cass-Hoot cumplió dos mandatos bajo la presidencia de Barack Obama y fue el primer oficial de información de salud de la Administración de Drogas y Alimentos de EE. UU.
La secuenciación de un solo genoma humano puede requerir entre 80 y 150 gigabytes de almacenamiento, dijo Cass-Hout, y algunos proyectos de investigación se ocupan de petabytes y exabytes de información genética.
“Estás hablando de nueve trofeos de Harry Potter si los imprimieras en una impresora”, dijo Cass-Hoot a CNBC. “Y eso es solo para una persona”.
Amazon Omics ayuda a los investigadores a ordenar sus datos al proporcionarles tres componentes que pueden aprovechar individualmente o en combinación. El almacenamiento de objetos con reconocimiento ómico ayuda a los investigadores a almacenar y compartir datos de secuenciación sin procesar; Omics Workflows ayuda a ejecutar flujos de trabajo que procesan datos de secuencia sin procesar a escala; Y Omics Analytics simplifica el procesamiento de secuencias de salida.
Más de una docena de clientes y socios han probado el servicio en versión beta y ya están usando Amazon Omics.
Para Jeffrey Pennington, director de informática de investigación del Children’s Hospital of Philadelphia, ya ha tenido un impacto notable.
Pennington trabaja en el Departamento de Informática Biomédica y de la Salud, que utiliza datos y tecnología para resolver problemas relacionados con la salud infantil. Dijo que el ministerio había pasado cinco años expandiendo la infraestructura de análisis de datos ómicos, y ahora no necesitaban nada para construir o mantener.
“Somos un gran centro médico académico para niños, pero todavía no somos lo suficientemente grandes para aprender y construir todo lo que se necesita para hacer un uso productivo de los datos integrales”, dijo Pennington. “Es mejor gastar nuestro tiempo, energía, esfuerzo y recursos financieros armando el rompecabezas que creando esas piezas en primer lugar”.
Amazon Omics también fomenta la colaboración entre grandes grupos de investigación, grupos clínicos más pequeños y compañías farmacéuticas y de inteligencia, dijo Boris Oakland, cofundador y director de tecnología de C2i Genomics.
C2i es una empresa de biotecnología que trabaja para utilizar datos genómicos para desarrollar terapias personalizadas para el cáncer. Oklander dijo que la compañía participó en la versión beta de Amazon Omics después de intentar desarrollar su propia tecnología de análisis de datos.
Dijo que Amazon Omics ha creado un ecosistema de colaboración que elimina la necesidad de que los investigadores construyan tecnología compleja desde cero.
Él dijo: “Simplemente estamos democratizando”. Este tipo de servicio está permitido. [us] Desbloquear el valor de las inversiones realizadas por los diferentes actores en este campo. ”
Otras grandes empresas tecnológicas han desarrollado herramientas similares. microsoftLa plataforma de computación en la nube Azure lanzó Microsoft Genomics en 2018 para ayudar a los investigadores a interpretar los datos generados por las tecnologías genómicas. El GoogleLa tecnología de Cloud Life Sciences también permite a los investigadores procesar datos biomédicos a escala.
El Instituto Broad y DNAnexus también ofrecen servicios populares de análisis de datos del genoma, dijo Pennington, pero dijo que pueden ser difíciles de mantener y pueden analizar menos tipos de datos que Amazon Omics.
Dada la naturaleza altamente sensible y personal de los datos ómicos, Kass-Hout dijo que la privacidad y la protección de los datos de los pacientes es la “misión cero” para AWS. Dijo que AWS utiliza más de 300 servicios de seguridad, cumplimiento y gobernanza y admite 98 estándares de seguridad y certificaciones de cumplimiento. Al hacerlo, AWS “va más allá” del cumplimiento normativo, dijo Kass-Hout, y proporciona las mejores herramientas y recursos de cifrado a sus clientes.
Los clientes también son responsables de crear aplicaciones seguras sobre los servicios de Amazon Omics, que protegen a AWS de ver o beneficiarse de los datos.
En última instancia, Amazon Omics sirve como una forma de catalogar información de manera eficiente para que los investigadores puedan concentrarse en lograr avances reales en la medicina de precisión, dijo Kass-Hott.
“Si la última década se trató de la digitalización que atravesó la industria de las ciencias de la vida y la salud, realmente creo que la próxima década se trata de comprender estos datos de la manera en que se hace ahora. [where] Podemos encontrar nuevas terapias, nuevos diagnósticos y terapias más específicas”.